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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS |
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NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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蛋白表达定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
CNS新热点：R-Loop 转录调控的主动参与者！
—— 全新推出DRIP-Seq，把握R-Loop研究的新方向！
R -loop是由转录的RNA链与打开的双链DNA其中一条链发生碱基互补配对，形成RNA-DNA杂合链，同时使未配对的另一条DNA链游离在外组成的三方结构。R -loop分布广泛，占哺乳动物基因组的 5%，经常出现在基因组的启动子CGI和转录终止位点。已有研究表明，R -loop在调节基因表达、DNA 复制以及 DNA 和组蛋白修饰等方面均发挥着重要作用，具有重要的生物学功能。
Nat Genetics (IF 38.33): Antisense lncRNA通过形成R-loop影响coding RNA转录
Antisense lncRNA是与coding RNA转录方向相反，转录位置部分重合的长链非编码RNA，通常可以顺式调控临近coding RNA的转录。2019年Nature Genetics发表的文章发现，antisense lncRNA TARID通过形成R-loop影响临近coding RNA TCF21启动子去甲基化，进而调控TCF21表达和癌症进程。
TCF21是与一种抑癌基因，在多种癌症中表达下调，它具有头对头反义lncRNA TARID（TCF21 antisense RNA inducing demethylation）。TARID转录过程会在TCF21启动子附近形成R-loop，被R-loop识别蛋白GADD45a结合，GADD45a进而招募去甲基化酶TET1，促进DNA去甲基化来增强TCF21转录，影响细胞周期。
Antisense lncRNA TARID通过形成R-loop调控TCF21启动子DNA去甲基化及转录
DRIP-seq全新发布！
DRIP-seq（DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing）利用特异性识别DNA:RNA杂合链的S9.6抗体对包含R-loop结构的 DNA 链进行富集，后续通过DNA测序来实现 R-loop分析，侧重于通过NGS在基因组水平上检测R-loops结构的分布，并通过生物信息学分析在不同的领域从中挖掘出更多有用的信息。
DRIP-seq优势
严格的质控体系：设置阴性对照组和阳参，以控制文库质量。
稳定性高：实验操作稳定性高，减少实验操作带来的误差。
灵活度高：能够直接对有基因组信息的物种进行R-loop测序。
提供数据可视化，丰富的注释信息与文章发表级别的图谱
