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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS |
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NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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蛋白表达定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
RNC-circRNA芯片（以及lncRNA芯片）与Ribo-seq在研究目的上不同，它们之间没有竞争关系。RNC-circRNA/lncRNA芯片用于鉴定正进行翻译的RNA转录本，特别是对于circRNA、lncRNA而言，能否进行翻译比翻译效率高低更加重要[1]；而Ribo-seq用于检测mRNA密码子使用频率、以及与RNA-seq联合用于检测基因的翻译效率[2]。因此RNC联合circRNA、lncRNA芯片有其独特的研究方向和应用优势，并且在客户样本量较低时，也更适合选择RNC联合芯片实验。
在翻译组学中，mRNA与circRNA、lncRNA这些非编码RNA的研究侧重方向是不同的，对于mRNA而言，因为mRNA的翻译能力、翻译产物已被鉴定过，没必要重复验证，所以mRNA在翻译水平上的研究重心在于检测基因翻译效率的高低。
但对于circRNA、lncRNA而言，“能否进行翻译比翻译效率高低更加重要”，作为被普遍认为不具有编码功能的RNA分子，它们的翻译能力研究比ceRNA机制、表观修饰等常见思路更加新颖，且这些ncRNA编码的蛋白质能参与更复杂的表观调控、使它们的功能更全面。因此对circRNA、lncRNA的功能研究来说是一种从0到1的进步[3]，而此时翻译效率的高低只是对翻译能力的一个延伸，对刚刚起步的circRNA、lncRNA翻译研究来说，就没有这么大的意义了[4]。
我司RNC联合芯片实验与Ribo-seq的比较表格：
希望以上文章能帮助您根据您的研究目的做出正确的选择。
参考文献：
1. Lu, S., et al., Understanding the proteome encoded by "non-coding RNAs": new insights into human genome. Sci China Life Sci, 2020. 63(7): p. 986-995.
2. Jia, X., et al., Protein translation: biological processes and therapeutic strategies for human diseases. Signal Transduct Target Ther, 2024. 9(1): p. 44.
3. Lei, M., et al., Translation and functional roles of circular RNAs in human cancer. Molecular Cancer, 2020. 19(1): p. 30.
4. Wang, Y., et al., Expanding uncapped translation and emerging function of circular RNA in carcinomas and noncarcinomas. Mol Cancer, 2022. 21(1): p. 13.
